The focal S:N501 build is now updated with data from 13 Jan!

There are a total of 247 non-UK & non-South African sequences in 501Y.V1 (B.1.1.7 #b117) & 501Y.V2.

I'll do an additional thread later on, covering S:E484 & the 'Ohio variants'.

1/18

https://t.co/3bdttjKVl4

There are 244 new sequences in 501Y.V1 (B.1.1.7) from Australia, Belgium, Denmark, Germany, India, Israel, Italy, Netherlands, New Zealand, Norway, Portugal, Singapore, Spain & USA, as well sequences as from Ecuador and Greece for the first time.

2/18
Greece has 3 new sequences in 501Y.V1 for the first time. They indicate 2 separate introductions.

Ecuador has 2 sequences for the first time. They also indicate 2 separate introductions.

3/18
The USA has 61 new sequences (orange), from Florida, Minnesota, California, Pennsylvania, & New York.

A few of these represent separate introductions. Others form distinct clusters that may indicate ongoing local transmission.

4/18
Israel has 35 new sequences (orange). Some of these show separate introductions, but many link with older sequences, indicating ongoing local transmission.

5/18
The Netherlands has 34 new sequences (orange). A few of these represent separate introductions, but most form a large cluster with older sequences from the Netherlands, indicating ongoing local transmission.

6/18
Portugal has 31 new sequences (orange). Though hard to see in the zoomed-out view, most of these represent separate introductions. There is one case where 2 new seqs are identical to an older one, but this could be a common exposure source.

7/18
Denmark has 20 new sequences (orange). A few of these indicate separate introductions, but must cluster with older sequences in smaller groups or in the very large Danish group previously identified, indicating local transmission.

8/18
Norway has 14 new sequences (orange). Most indicate separate introductions, but a few are identical to or related to an older sequence, which may indicate local transmission.

9/18
Spain has 11 new sequences (orange). All of these indicate separate introductions, though some new sequences link together to form tight clusters. This could indicate local transmission or a common source.

10/18
New Zealand has 10 new sequences (orange). All represent separate introductions, though some new sequences are linked together.

11/18
Singapore has 6 new sequences (orange). Though hard to see in zoomed-out view, most of these indicate separate introductions.

12/18
Italy has 6 new sequences (orange). It's a bit hard to see in the zoomed-out view, but none of these link directly with older samples, indicating separate introductions - though 2 new seqs link together.

13/18
Germany has 4 new sequences (orange). Though hard to see in the zoomed-out view, these all represent separate introductions.

14/18
Australia also has 4 new sequences (orange), including the first from Western Australia. These indicate separate introductions, though 2 of the new sequences are identical (marked in red).

15/18
India has 2 new sequences (orange, one hidden behind the green - pic 1). One is a separate introduction, the other links with a previous sequence (pic 2).

Belgium has 1 new sequence, which links 1 mutation away from a previous sequence (pic 3).

16/18
There are 3 new non-South African sequences in 501Y.V2, from Germany for the first time. They are identical, which may indicate a common exposure.

17/18
The updated country plots will go up soon, and I'll add another thread later on S:E484 & the 'Ohio variants'.

18/18
The updated country plots are now up. As always, be careful interpreting plots as many countries are selectively sequencing S:N501 & S-drop outs (which often increases S:N439), so frequencies are often not representative!

19/18

https://t.co/c7wlQOufTQ

More from Dr Emma Hodcroft

Each day brings new challenges, but here's an update to the dedicated S.N501 build, using data from 6 Jan 2021 to keep you going.

There are 42 new non-UK sequences in 501Y.V1 (B.1.1.7) & 7 new non-South-African sequences in 501Y.V2.

1/14

https://t.co/kT1gFsSZn0


There are 42 new non-UK sequences in 501Y.V1 from the Netherlands, Italy, Hong Kong, Finland, Sweden, Germany, USA, Switzerland, Brazil, and the first sequence from 501Y.V1 in Oman.

https://t.co/XA8VR8HiEq

2/14


Oman has their first sequence which falls into 501Y.V1:

3/14


Finland has 12 new sequences (orange), which mostly represent separate introductions. Zooming in (divergence view), we can see 3 of the new sequences are identical (red), which may indicate the cases are connected.

4/14


Sweden has 8 new sequences (orange), which indicate separate introductions.

5/14

More from Society

You May Also Like

#ஆதித்தியஹ்ருதயம் ஸ்தோத்திரம்
இது சூரிய குலத்தில் உதித்த இராமபிரானுக்கு தமிழ் முனிவர் அகத்தியர் உபதேசித்ததாக வால்மீகி இராமாயணத்தில் வருகிறது. ஆதித்ய ஹ்ருதயத்தைத் தினமும் ஓதினால் பெரும் பயன் பெறலாம் என மகான்களும் ஞானிகளும் காலம் காலமாகக் கூறி வருகின்றனர். ராம-ராவண யுத்தத்தை


தேவர்களுடன் சேர்ந்து பார்க்க வந்திருந்த அகத்தியர், அப்போது போரினால் களைத்து, கவலையுடன் காணப்பட்ட ராமபிரானை அணுகி, மனிதர்களிலேயே சிறந்தவனான ராமா போரில் எந்த மந்திரத்தைப் பாராயணம் செய்தால் எல்லா பகைவர்களையும் வெல்ல முடியுமோ அந்த ரகசிய மந்திரத்தை, வேதத்தில் சொல்லப்பட்டுள்ளதை உனக்கு

நான் உபதேசிக்கிறேன், கேள் என்று கூறி உபதேசித்தார். முதல் இரு சுலோகங்கள் சூழ்நிலையை விவரிக்கின்றன. மூன்றாவது சுலோகம் அகத்தியர் இராமபிரானை விளித்துக் கூறுவதாக அமைந்திருக்கிறது. நான்காவது சுலோகம் முதல் முப்பதாம் சுலோகம் வரை ஆதித்ய ஹ்ருதயம் என்னும் நூல். முப்பத்தி ஒன்றாம் சுலோகம்

இந்தத் துதியால் மகிழ்ந்த சூரியன் இராமனை வாழ்த்துவதைக் கூறுவதாக அமைந்திருக்கிறது.
ஐந்தாவது ஸ்லோகம்:
ஸர்வ மங்கள் மாங்கல்யம் ஸர்வ பாப ப்ரநாசனம்
சிந்தா சோக ப்ரசமனம் ஆயுர் வர்த்தனம் உத்தமம்
பொருள்: இந்த அதித்ய ஹ்ருதயம் என்ற துதி மங்களங்களில் சிறந்தது, பாவங்களையும் கவலைகளையும்


குழப்பங்களையும் நீக்குவது, வாழ்நாளை நீட்டிப்பது, மிகவும் சிறந்தது. இதயத்தில் வசிக்கும் பகவானுடைய அனுக்ரகத்தை அளிப்பதாகும்.
முழு ஸ்லோக லிங்க் பொருளுடன் இங்கே உள்ளது
https://t.co/Q3qm1TfPmk
சூரியன் உலக இயக்கத்திற்கு மிக முக்கியமானவர். சூரிய சக்தியால்தான் ஜீவராசிகள், பயிர்கள்